Несомненно, рисосеяние на берегах залива, имеет негативное влияние на экологическое состояние прибрежных вод, в заливе. Но совершенно не тем, что при сбросе с чеков воды в залив попадает вымываемый с полей гумус и грунт! Как раз сбрасывается совершенно чистая, без взвесей вода. Она намного прозрачней воды, которая течет, по Краснознаменскому каналу. Но ее сток несет в залив, другую опасность -расстворенную в ней, амиачную селитру. В связи с плохой циркуляцией прибрежных вод, повышенная ее концентрация, стимулирует бурный рост нитчатых водорослей. Которые разростаясь, заполняют толщу воды, до повехности. В результате, застой прибрежных вод усиливается, а созданый барьер, не пускает зостеру к берегу. Из за чего, зостера в большом количестве, затапливается вдали от берега образуя вал. Этот вал подвергается разложению, вместе с массой нитчатых водорослей, образуя в итоге ил.
Весной, интенсивными ветрами южных направлений, этот ил, транспортируется к берегу.
Конечно мы не сможем запретить выращивание риса, но нужно добиваться запрета на применения в качестве удобрения амиачной селитры. Так же реставрация на побережьи лагун, позволит улучшить циркуляцию прибрежных вод, что разбавит,возле берега, концентрацию химических загрязнителей поступающих с полей. А так же, помогут справиться с последствиями илообразования, на мелководье.
P. S. В ковш порта, так же попадает и затапливается большое количество зостеры, где она после разложения, превращается в зостеровый ил.
Джарылгачский залив и урочище Цукур.